MSc bioinformaatika ja arvutusgenoomika

Viimasel kümnendil on molekulaar- ja biomeditsiinitehnoloogias tehtud tohutuid edusamme, mille tulemuseks on „oomika” revolutsioon.

Bioinformaatika hõlmab matemaatika, statistika ja andmetöötluse rakendamist bioloogilistes ja kliinilistes stsenaariumides. Patsientidelt saadud suurte andmete mõistmiseks ja tõlgendamiseks kasutatakse algoritme ja tarkvaratööriistu.

Mis on sellega seotud?

Analüüsite kliinilisi ja omika andmeid, et leida keerukaid mustreid, mis on seotud patsiendi ravivastusega ja prognoosiga. Kliiniliste uuringute või kommertsialiseerimise kaudu avastate tulemusi, mis tõlgivad tegelikku maailma. Kasutate oma nägemust kliinilistele ja bioloogilistele probleemidele ainulaadsete lahenduste leidmiseks ning kraadi lõpuks olete valmis töötama multidistsiplinaarses meeskonnas koos bioinformaatikute, bioloogide ja arstidega Patrick G Johnstoni vähiuuringute keskusest. Tere tulemast Wolfsoni eksperimentaalse meditsiini instituuti ja rahvatervise keskusesse.

Seda täiendavad tööstus- ja kliiniliste koostööpartnerite külalisloengud.

Taotlejatel soovitatakse septembri lõpus algavatele kursustele kandideerida võimalikult varakult ja ideaaljuhul hiljemalt 31. juulil 2022. Juhul, kui mõnele programmile laekub palju avaldusi, jätab ülikool endale õiguse taotlusportaal sulgeda.

Pange tähele, et kursusel osalemise tagamiseks tuleb tasuda tagatisraha. Suure nõudluse tõttu ei pruugita avaldusi arvesse võtta, kui kursus on saavutanud oma maksimaalse klassi mahu ja kantakse ootenimekirja.

Bioinformaatika ja arvutusgenoomika esiletõstmised

Suurandmete analüüs võib anda võtme erinevate haiguste, näiteks vähi põhjuste ja arengu avamiseks. Samuti pakub see väljavaateid uute ravimite ja ravimeetodite väljatöötamiseks, et haigusseisundeid ja haigusi ennetada ja ravida.

Globaalsed võimalused

• Te olete seotud meie Patrick G Johnstoni vähiuuringute keskusega, mis teeb koostööd partneritega üle maailma, arendades vähiravi ja teedrajavaid edusamme patsientide ravis. Keskusel on rahvusvaheline maine tipptasemel teadusuuringute eduka levitamise ja rakendamise, teadmussiirde ning teadusideede ja uuenduste kommertsialiseerimise eest.

Rahvusvaheliselt tunnustatud eksperdid

• Te olete seotud meie Vähiuuringute ja Rakubioloogia Keskusega, mis teeb koostööd partneritega üle maailma, arendades vähiravi ja teedrajavaid edusamme patsientide ravis. Keskusel on rahvusvaheline maine tipptasemel teadusuuringute eduka levitamise ja rakendamise, teadmussiirde ning teadusideede ja uuenduste kommertsialiseerimise eest.

"Oomika" andmete kiire tootmine meditsiinis ja bioteadustes on tähendanud, et selles valdkonnas analüütilise kogemusega isikud on väga nõutud. Hiljutised koolilõpetajad on jätkanud tööd selles valdkonnas sellistes ettevõtetes nagu Almac Diagnostics, Biokinetic Europe ja Fios Genomics ning mõned on jätkanud PHD-taseme uurimist.

Töö pärast kursust

Paljud meie üliõpilased jätkavad bioinformaatika doktoriõppes Queenis ja kaugemalgi. Teised jätkavad tööd erinevatel ametikohtadel nii era- kui ka avalikus sektoris siin Põhja-Iirimaal ja rahvusvaheliselt. Järgmised on mõned töökohad, mille nad on võtnud:

• Bioinformaatika Belfasti tervishoiu- ja sotsiaalhoolekandeasutuses
• Dotmatika teadlane
• Darktrace'i võrgu- ja turvamehaanik
• Almac Grupi noorem bioinformaatika teadlane
• Bioinformaatika Fios Genomics Ltd-s
• Biomeditsiiniteadlane ja noorem Bioinformaatika, BioKinetic Europe

Ametialased võimalused

Queen's kraadiõppurid saavad erakordseid eeliseid. Sellised unikaalsed algatused nagu Degree Plus ja Research Scholars toetavad meie pühendumust tööalase konkurentsivõime tõstmisele, samas kui uuenduslikud juhtimis- ja rakendusprogrammid koos ettevõtjate ekspertidega integreeruvad, aitab meie õpilastel omandada olulisi juhtimispositsioone nii riiklikul kui ka rahvusvahelisel tasandil.

Õpilased võivad registreeruda täisajaga (üks aasta). Esimese kahe nädala jooksul on sissejuhatav moodul rakubioloogia ja arvutusliku analüüsi jaoks. Sellele järgnevad kolm (20 CAT) moodulit 1. poolaastal ja neli moodulit (2 x 20 CAT ja 2 x 10 CAT) 2. poolaastal.

MSc antakse õpilastele, kes on edukalt läbinud kõik õpetatud moodulid (120 CATS) ja väitekirja (60 CATS).

Diplomi väljapääsu kvalifikatsioon on saadaval neile õpilastele, kes on edukalt läbinud 120 CATS-punkti õpetatud mooduleid.

Sertifikaadi väljapääsu kvalifikatsioon on saadaval neile õpilastele, kes on edukalt läbinud 60 CATS-punkti õpetatud mooduleid.

Bioinformaatika ja arvutusgenoomika on interdistsiplinaarne valdkond, mis on biomeditsiiniliste uuringute, avastamise ja praktika keskmes. Oma väljakutseid pakkuva ja rahuldust pakkuva sisuga annab see magistrikraad arvutus- või bioteaduste taustaga õpilastele võimaluse liikuda uude põnevasse avastus-, tehnoloogia- ja rakendusvaldkonda. Pakume laia õppebaasi ja pakume koolitust avatud lähtekoodiga programmeerimiskeeltest, mida tavaliselt kasutatakse akadeemilistes ringkondades ja tööstuses.

Alustate sissejuhatava lühikursusega (kaks nädalat esimese semestri alguses) rakubioloogias, millele järgnevad kohustuslikud moodulid:

SCM8051 geeniekspressiooni analüüs – 20 KATS

See moodul annab praktilised molekulaarbioloogilised teadmised, mis on vajalikud kõige tõhusamate ja kasulike arvutusvahendite väljatöötamiseks geeniekspressiooniandmete analüüsimiseks.

SCM8095 genoomika ja inimhaigused – 20 kassi

See moodul uurib kiiresti arenevaid valdkondi, mis liiguvad spetsialiseeritud uurimisvaldkondadest tavameditsiini, teaduse ja avalikele areenidele. Genoomimeditsiini põhimõtteid arutatakse koos bioinformaatika lähenemisviisidega inimeste haiguste "põhjustavate geenide" tuvastamiseks.

SCM7047 teaduslik programmeerimine ja statistiline andmetöötlus – 20 CATS

See moodul hõlmab statistilise raamistiku R ja programmeerimiskeele Python põhielemente. See tutvustab paralleelse töötlemise rakendusi ja juurutamist ning seda, kuidas tänapäevaseid suurandmeprobleeme HPC andmetöötluse abil ära kasutada.

SCM8148 Tervise- ja biomeditsiiniline informaatika ja eksponaat (poolmoodul 10 CATS)

Moodul hõlmab terviseinformaatika erinevaid aspekte, sealhulgas elektrooniliste tervisekaartide (EHR) põhistruktuuri. See moodul sisaldab ka sissejuhatust eksposoomi kontseptsiooni ja biomeditsiinilise informaatika panusesse ekspositsiooniuuringutes.

SCM8152 süsteemimeditsiin: molekulidest populatsioonideni (pool moodulit 10 CATS)

Õpilased arendavad teadmisi integreerivate lähenemisviiside kohta multi-'oomika biomeditsiiniliste andmete analüüsiks, et valgustada haiguse mehhanisme, kasutades rakendusi täppismeditsiinis. Süsteemne meditsiin ühendab mitu teadusharu; Mõned selle mooduli põhivaldkonnad on võrgubioloogia, masinõpe ja patsientide kihistumine.

SCM8108 rakendusgenoomika – 20 KATS

Selles moodulis uuritakse praktilisi väljakutseid erinevate omics-andmekogumite loomisel, selle olulist mõju selliste andmekogumite analüüsimisel ning antakse praktilisi kogemusi saadud andmekogumite käsitlemisel asjakohaste tööriistade abil.

SCM8109 Biostatistiline informaatika (võrgus) – 20 KATS

Selle mooduli tuum tõstab esile kliinilis-patoloogiliste ja oomikaandmete analüüsi. Moodul annab ka sissejuhatuse põhiliste statistiliste testide läbiviimisesse statistilises programmeerimiskeeles R.

Uurimisprojekt: Väitekiri – 60 CATS

Translatiivse bioinformaatika ja tehnilise arengu uurimisprojektid jagunevad peamiselt Patrick G Johnstoni vähiuuringute keskuse ja Wellcome Wolfsoni eksperimentaalmeditsiini instituudi vahel.

Teid õpetavad aineeksperdid Patrick G Johnstoni Vähiuuringute Keskusest (https://www.qub.ac.uk/research-centres/cancer-research/), Wellcome Wolfsoni Eksperimentaalmeditsiini Instituudist (https:/ /www.qub.ac.uk/research-centres/wwiem/) ja Rahvatervise Keskus (https://www.qub.ac.uk/research-centres/CentreforPublicHealth/). Seda täiendavad tööstus- ja kliiniliste koostööpartnerite külalisloengud.

Keskkond

Teid õpetavad aktiivsed teadlased, sealhulgas bioloogid, arstid ja bioinformaatikud. Meil on ka meie tööstuspartnerite õpetamise panus.

Uurimisprojektide ajal võib teil olla võimalus töötada doktorantide kõrval ülikoolilinnaku avatud planeeringuga keskkondades, kuid kursus on paindlik. Sellel kursusel saavad üliõpilased kasutada komplekti kõrgtehnoloogilisi personaalarvuteid.

Õppimine ja õpetamine

Pakume erinevaid õpikogemusi, mis võimaldavad meie õpilastel suhelda aineekspertidega, arendada omadusi ja vaatenurki, mis annavad neile eluks ja tööks arenenud ühiskonnas, kasutades uuenduslikke tehnoloogiaid.

Hommikul ja pärastlõunal toimuvate tundide kombinatsiooni näitel on sellel kursusel õppimise võimalusteks loengud, praktiliste kogemuste õppimise tehnoloogiad ja enesejuhitud õpe tööalase konkurentsivõime suurendamiseks.

Hindamine

Kursusega seotud hinnangud on toodud allpool:

Moodulite hindamine põhineb 100% kursuste / klassitestide / väitekirja koostamisel.

PG-diplomi saavad anda üliõpilased, kes läbivad kõik õpetatavad moodulid, kuid ei suuda väitekirjas saavutada vähemalt 50% -list hinnet.

PG-tunnistuse saavad üliõpilased, kes läbivad 60 CATS-moodulit.